Den 1 januari 2008 ersattes SBU:s styrelse av Nämnden för medicinsk utvärdering. Regeringen har förändrat styrelseformen för en rad myndigheter, däribland SBU, för att hela den statliga förvaltningen ska bli mer effektiv. Det övergripande ansvaret för myndighetens verksamhet och ekonomi har nu SBU:s chef, i stället för en styrelse. Nämndens sammansättning och uppgifter liknar i övrigt den tidigare styrelsens. Ordföranden och ledamöterna i nämnden är som tidigare utsedda av regeringen.